环境微生物多样性检测

环境微生物的群落结构及多样性和微生物的功能及代谢机理是微生物生态学的研究热点。基于Roche 454 FLX +、Illumina MiSeq等第二代高通量测序平台,对核糖体RNA高变区域和功能基因进行测序,揭示环境样品中不同类型微生物种类以及它们之间的相对丰度和进化关系,进行环境微生物群落多样性分析。以医疗领域的应用为例,通过比较正常和疾病状态,甚至疾病不同进程中人体微生物群落的结构和功能变化,可以对正常人群与某些疾病患者体内的微生物群体多样性进行比较分析,获得人体微生物群落变化同疾病之间的关系;通过深度测序还可以快速地发现和检测常见病和新发传染病病原微生物。


相关文献:

[1].Sunagawa S,Coelho L P,Chaffron S,et al.Structure and function of the global ocean microbiome [J]. Science, 2015, 348(6237): 1261359.
[2].Fierer N,et al.Cross-biome metagenomic analyses of soil microbial communities and their functional attributes.Proceedings of the National Academy of Sciences,2012,109(52):21390-21395.
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