微生物基因组测序

随着微生物基因组研究的迅速发展,全基因组测序已逐步成为微生物基础研究的重要手段之一。基于新一代高通量测序技术的全基因组测序,可以预测重要基因和蛋白,帮助研究者了解功能和可能机制。细菌基因组测序已逐步取代传统方法,成为研究细菌进化遗传机制和关键功能基因的有效工具。
基因组从头测序是指不需要任何现有的序列资料就可以对某个物种进行测序,再利用生物信息学分析手段对序列进行拼接,组装,从而获得该物种的基因组图谱。微生物生物多样性丰富,基因组具有较小、重复序列较高、易于突变等特点,因此很必要对微生物进行全基因组测序。技术层面包括框架图、精细图和完成图。

 

相关文献:

 [1].Wu Z, et al. Comparative Genomic Analysis shows that Streptococcus suis Meningitis Isolate SC070731 Contains a Unique 105 K Genomic Island. Gene. 2014 Feb 10;535(2):156-64.

[2].Liu F, Hu Y, Wang Q, et al. Comparative genomic analysis of Mycobacterium tuberculosis clinical isolates. BMC genomics, 2014, 15(1): 469.

 

 

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