RNA Sequencing

转录组是某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA的总和,是研究细胞表型与功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间与空间的限定。同一细胞在不同的时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。
转录组测序,也被称为“鸟枪法转录组测序”,指的是为了得到一个样本中RNA的序列和表达信息,应用二代测序平台对cDNA进行高通量深度测序技术。凭借其深度覆盖和高精度的特征,RNA-seq可用于基因差异表达,鉴定可变剪接,发现新的mRNA isoforms,ncRNA,预测SNP位点,鉴定融合基因等多方面研究。该技术被称为“转录组学研究的革命性工具”,被广泛应用于植物杂交,癌症研究,动物育种,发育生物学,神经生物学,植物逆境研究等研究领域。
烈冰依托于最新的Ion Proton测序仪以及传统的Illumina Hiseq 2500测序平台,为研究者提供多样化的测序服务和深入的测序数据分析服务。2014年,在转录组测序领域,烈冰已协助研究者发表多篇文献,平均影响因子达到10,涵盖植物杂交,医学研究,动物科学,发育生物学研究等多个领域。

 

相关文献

[1]. Zhang XY,et al.Gonadal Transcriptome Analysis in Sterile Double Haploid Japanese Flounder.PLoS ONE 10(11): e0143204. doi:10.1371/journal.pone.0143204 (IF 3.234)
[2].
Liu Z,et al.Autism-like behaviours and germline transmission in transgenic monkeys overexpressing MeCP2. Nature.doi:10.1038/nature16533(IF 41.4)

[3]. Wang W, et al. Global transcriptome-wide analysis of CIK cells identify distinct roles of IL-2 and IL-15 in acquisition of cytotoxic capacity against tumor. BMC Med Genomics. 2014 Aug 9;7:49. (IF=3.69)

 
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