circRNA-Seq环状RNA测序

在近十余年的生命科学研究中非编码调控RNA可谓是研究最火的领域之一,从06年诺奖的siRNA,到这几年异常火爆的microRNA,到登场并风靡全世界的lncRNA,到当今最前沿的环状RNA(即circRNA),可谓如火如荼,相关领域之广,相关机制之多,被众多研究者视为主要研究方向。
从机制上看,环状RNA(circRNA)是区别于传统线性RNA的一类新型RNA,具有闭合环状结构,大量存在于真核转录组中。大部分的环状RNA是由外显子序列构成,在不同的物种中具有保守性,同时存在组织及不同发育阶段的表达特异性。由于环状RNA对核酸酶不敏感,所以比线性RNA更为稳定,这使得环状RNA在作为新型临床诊断标记物的开发应用上具有明显优势。此外,近期研究显示,环状RNA在不同物种中起到miRNA海绵的作用,称之为竞争性內源RNA(ceRNA),能竞争性结合miRNA,从而调控靶基因的表达。这说明:环状RNA可能通过竞争性结合疾病相关的miRNA在疾病调控中发挥着非常重要的作用。

 

相关文献
[1]. Liu Q et al.Circular RNA Related to the Chondrocyte ECM Regulates MMP13 Expression by Functioning as a MiR-136 'Sponge' in Human Cartilage Degradation.Scientific Reports, 2016,6:22572,doi: 10.1038/srep22572.
 

 

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