lncRNA-Seq

在近十余年的生命科学研究中非编码调控RNA可谓是研究最火的领域之一,从06年诺奖的siRNA,到这几年异常火爆的microRNA,到登场并风靡全世界的lncRNA,到当今最前沿的环状RNA(即circRNA),可谓如火如荼,相关领域之广,相关机制之多,被众多研究者视为主要研究方向。
从机制上看,RNA不仅仅只承担遗传信息中间载体的辅助性角色,而是更多地承担了各种调控功能。lncRNA在发育和基因表达中发挥的复杂精确的调控功能极大地解释了基因组复杂性之难题,同时也为人们从基因表达调控网络的维度来认识生命体的复杂性开启新的天地。研究者大部分研究集中于短 RNA如 microRNA,piRNA 等一些 ncRNA 生物生成机制和调控通路,甚至在一些人类复杂疾病中的功能,但是这都只是冰山一角。人们对lncRNA(Long noncoding RNAs, LncRNAs) 的认识还处在初级阶段,lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能。
然而,有文献进一步研究表明,lncRNA参与了大量的生物学进程包括X染色 体沉默,基因组印记以及染色质修饰,转录激活,转录干扰,核内运输等多种重要的调控过程,lncRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。哺乳动物 基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是lncRNA(相应的蛋白编码RNA的比例是1%),虽然关于lncRNA的研究进展迅猛,但是绝大部分的lncRNA的功能仍然是不清楚的,随着研究的推进,各类 lncRNA 的大量发现,lncRNA 的研究将是 RNA 基因组研究非常吸引人的一个方向,使人们逐渐认识到基因组存在人类知之甚少的“暗物质”。

 

相关文献

[1]. Li H,et al.Characterization of Differentially Expressed Genes Involved in Pathways Associated with Gastric Cancer. PLoS ONE 10(4): e0125013.doi:10.1371/journal.pone.0125013.

 
 
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