ChlP-Seq

染色质免疫共沉淀(CHIP)是在体内环境中研究蛋白质与DNA相互作用的经典实验方法,广泛应用于组蛋白修饰、特定转录因子的基因调控作用等相关领域。采用新一代高通量测序技术,可在全基因组范围内对蛋白结合位点进行高效准确地筛选鉴定,同时也为研究的深入开展打下基础。

采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后,分离与其结合的基因组DNA片段,再通过高通量测序与数据分析,在全基因组范围内寻找目的蛋白的DNA结合位点,并且可以基于多个样品进行差异比较。

  

 

相关文献:

  [1].  Barski A, et al. High-resolution profiling of histone methylations in the human genome. Cell. 2007,129:823-837 

  [2].Wang CM,et al.An effective approach for identification of in vivo protein-DNA binding sites from paired-end ChIP-Seq data. Bmc Bioinformatics, 2010, 11(3):411-420

 

 

 

 

 

 

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