拉帕替尼与miRNA关系研究

 

  烈冰生物云协助北京同仁医院、金陵医院、上海交通大学、上海师范大学发表五篇文献!囊括从转录组,Denovo转录组,miRNA到基因组研究全方位,里面都有烈冰云平台的功劳,我们以两篇为例进行以下解读。

烈小冰RNA-Seq分析模块助力泪腺淋巴上皮病变研究
  Ma J M, et al. Int J Ophthalmol. 2015 Aug 18; 8(4):685-9.

  烈冰生物云协助北京同仁医院的研究者鉴定了TCR信号通路和泪腺良性淋巴上皮病变(BLEL)的关系。他们选取了9个病人样本,进行了高通量研究,烈冰生物云专业数据分析深度挖掘后发现,TCR信号通路中的27个基因表达显著变化。经RT-PCR和免疫组化验证,TCR信号通路中的CD3和CD4在泪腺良性淋巴上皮病变(BLEL)中表达。证明TCR信号通路确实和泪腺良性淋巴上皮病变(BLEL)有关系。 
 

miRNA分析模块协助发现拉帕替尼作用
  Nie W, et al. J Cell Physiol. 2015 Jul; 230(7):1 630-9.

  烈冰生物云协助金陵医院和南方医科大学的研究者,对药物拉帕替尼处理前后的miRNA高通量数据进行了深入的分析,揭示了拉帕替尼诱导的p27上调和Her-2信号通路转变过程中关键的miRNA,结果发表在国际著名学术期刊Journal of Cellular Physiology,2015年230期。本研究通过差异表达分析筛选到受拉帕替尼影响显著的7个miRNA,再通过KEGG通路分析聚焦到和Her-2通路密切相关的miR-1470、miR-126、miR-1208三个miRNA。研究者则进一步通过荧光素酶报告体系直接证实了其中的miR-1470结合在c-jun基因转录本的3'UTR,这与烈冰靶基因预测的结果非常吻合。本文揭示了miR-1470通过靶向作用于c-jun介导了拉帕替尼诱导的p27表达上调。 

   


五篇文献: 

[1]. Ma J,et al.Association of TCR-signaling pathway with the development of lacrimal gland benign lymphoepithelial lesions.Int J Ophthalmol.Vol.8 No.4.2015 Aug.18;2222-3959

[2]. Nie W,et al.miR-1470 Mediates Lapatinib Induced p27 Upregulation by Targeting c-jun.J.Cell.Physiol.2015;230: 1630–1639.(IF 3.839)

[3]. Lu Y,et al. Development of genome-wide insertion/deletion markers in rice based on graphic pipeline platform.Journal of Integrative Plant Biology.2015 Mar.21;online www.wileyonlinelibrary.com 

[4]. Lian G,et,al.Origins and Evolution of WUSCHEL-Related Homeobox Protein Family in Plant Kingdom.The Scientific World Journa.Volume 2014, Article ID 534140, 12  

[5]. Cui L,et al.Transcriptome exploration for further understanding of the tropane alkaloids biosynthesis in Anisodus acutangulus.Mol Genet Genomics.2015 290:1367–1377.

 

 

 

 

关于烈冰
企业介绍
发展历程
技术实力
新闻动态
开发日志
产品服务
基因组
转录组
代谢组
微生物
生物信息
生物应用
云平台
临床检测
个体化医疗
环境检测
科学研究
测序平台
实际案例
研究成果
技术互动
合作客户
021-51827998电话:4000-651-811
邮箱:tech@novelbio.com

上海市闵行区新骏环路138号漕河泾开发区2号楼2F

加入我们|资讯平台|法律声明

版权所有@上海烈冰信息科技有限公司 2015    沪ICP备14047938号

沪公网安备 31011202001835号