烈冰8周年!NovelBrain®云平台再升级至V3.0,让NovelBrain实现里程碑式飞跃!

日期:2018-3-22 16:10:50
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       烈冰NovelBrain®云平台自上线以来,受到了广大科研工作者以及企业的高度关注,并接受了众多科研团队的全方位、多层次的平台功能和安全测试,在业界内掀起了一股NovelBrain云计算风潮。

       烈冰一直以“Novel”为准则,向大家传递新的知识、新的方法、新的技术,以及新的产品。作为烈冰科技耗时八年推出的重量级产品,NovelBrain®云平台更是致力于向所有科研和医疗行业工作者提供最新的、最便捷的、最高效的数据分析体验,让每一个普通人都可以轻松了解自己数据的价值,并赋予数据生物学意义。
       为实现NovelBrain的崇高愿景,不断进行自我更新,增加大数据分析计算产能,完善平台运行机制,成为了NovelBrain®云平台持续发展的必要环节。事实上,NovelBrain的研发团队一直在努力,NovelBrain®云平台从V1.0升级到V2.0,在给用户带来更多惊喜体验的同时,我们也在更细致地去思考自身的不足。值烈冰8周年之际,再次更新升级的V3.0版本携新功能惊艳面世,实现了NovelBrain的里程碑式飞跃!
       新的V3.0上线了GCN(基因功能网络绘制软件),增加了自动化弹性结果报告系统,完善了最科学最前沿的生物信息学工具和人机交互文档,同时还实现了人类基因组重测序分析的大幅度加速,4小时即可完成单样本的分析,打破了人重分析的瓶颈。具体更新内容见下表:
       看到这儿,大家可能还无法get到这波更新的意义所在,莫慌,烈小冰下面就带您了解更新后的NovelBrain®云平台V3.0可以实现的强大功能~
       从该表可以看出,NovelBrain®云平台针对不同客户群体的多方面需求,在V2.0版本的基础上进行了再次重大升级,全方位优化不同用户的使用体验。
针对不同需求的用户,平台主要做了以下几点改进:
1. 提供了更准确和易懂的各类文档。帮助用户在毫无生信基础的情况下,也能轻松上手平台操作,快速准确灵活地整合生物信息软件及Pipeline;
2. 增加了大量最前沿的分析工具。不仅涵盖有甲基化宏基因组群体遗传单细胞测序等分析,同时还紧追国际最新进展,定制化开发了生物学意义挖掘模块
3. 重点加强了报告可视化,可读性和关联性更强,可自动浏览结果报告。上线了独立自主开发的GCN功能网络可视化软件,可以在结果中直观展示生物学意义的功能传导路径。增加了自动化结果报告判读系统,方便医疗客户在报告中快速了解临床信息;
4. 自主开发NB三重调度加速框架,最终实现了人类重测序分析的大幅度加速,4小时即可完成单样本的测序分析,较传统的分析方法提高了十多倍速度;
5. 针对大型研究室、测序工厂和企业用户,NovelBrain®云平台V3.0额外升级了一系列的功能,降低了第三方软件上线的工作量。针对科学研究的复杂性和可重复性,烈冰舍去复杂的文件配置,一键命令即可添加第三方软件上线;对虚拟镜像管理界面进行了全方位优化,Docker镜像管理一体化;本着跨界共享的精神,开放了众多平台接口,更灵活地进行平台对接,随心所欲地进行软件二次开发。
       对NovelBrain®云平台有一定了解的老师可能知道,为了满足不同用户的实际需求,NovelBrain®云平台共推出了4款产品供大家选择,分别是:Solar企业版公有云Diamond私有云Legend一体机Skywalker公有云。关于以上的更新内容,4款产品中存在些许差异,譬如Legend一体机和Skywalker公有云中,考虑到性能和安全性问题,暂时没有添加第三方软件的功能和API开放的升级。详情见下表:
       经过此次升级,NovelBrain®云平台V3.0成为数不多的上线基因功能网络绘制软件的生物云平台之一。接下来,烈小冰向大家着重介绍一下烈冰自主开发的GCN功能网络可视化软件上线将为平台用户带来的便捷之处。
       很多老师都知道,CytoScape是一款用来做生物分子网络图的作图工具,其绘制的网络图可直观展示基因互作关系。但对于生信小白来说,学习使用CytoScape软件作图的时间成本太高,操作起来也是相当繁琐☟
 
       NovelBrain®云平台V3.0上线的GCN功能网络可视化软件,只需几步简单的点击操作和参数设置,即可一键实现网络图的绘制,并可对网络节点的样式和形状进行任意修改。用户如果想用高级功能,也可将数据导出并与cytoscape互通。
   
以下是NovelBrain®可以展示的图片形式:
    
GO-Tree网络
    
 
物种富集网络
       GCN上线只是NovelBrain®云平台V3.0更新的众多内容之一,由于篇幅问题,这里不再做过多介绍,对于其他更新板块感兴趣的老师可以直接联系我们进行咨询。NovelBrain®云平台V3.0也欢迎各位老师进行压力测试,并向我们提出宝贵的意见和建议。您的支持就是我们的最大动力!更多后续更新请持续关注哦!
       至此,NovelBrain®云平台V3.0成为国际上更懂科研、更了解临床的生物医疗云平台之一,实现了NovelBrain的重大突破。在过去的一个月里,NovelBrain已经部署至三家拥有NovaSeq的企业,达成长期战略合作意向; 1家大型公有云机构达成意向协议;2家三甲医院达成医疗合作框架,联合建立临床检验实验室;与3家临检机构建立NovelBrain医疗云开发平台。届时,NovelBrain的公有云注册用户突破10000,充值合作用户突破1000人,培训专业人数突破400人。
       更振奋的事情是,本次V3.0版本升级,会第一时间更新到老用户的平台上,烈冰安全稳定可靠的运维体系,为NovelBrain的热爱者保驾护航。
烈冰8周年
       烈冰于2010年成立至今,身经百战,数百篇文献支持。8年间历经海量数据检验,已为600+国内外机构服务5000+项目,业务领域覆盖科研机构、大型药厂、医院、检验机构等。从国内首篇circRNA研究文章(Sci Rep. 2016 Mar 2;6:22572.)到首个人类血液外泌体长链RNA数据库exoRBase(www.exoRBase.org),从基于Ion Proton测序仪的第一篇转录组文献(BMC Med Genomics. 2014 Aug 9;7:49)到第一篇高分转录组文献(Nature. 2016 Feb 4;530(7588):98-102,NovelBrain®云计算平台身经百战,不惧考验,最懂科研!
       新的八年,新的考验,烈冰陪您继续前行!
 
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