Ion Proton 台式测序仪是Life Technologies于2012年初推出的最新型二代半测序技术。Ion Proton™系统采用半导体技术,可提供在几个小时内完成测序所需的速度。同时,利用Ion Proton™测序仪中先进的电子设备,可在测序仪内部实现密集型计算数据处理,能够于一天内在Ion Proton™系统附带的简单的台式服务器上进行计算密集程度较低的碱基检测和变异体检测。Ion PI™芯片包括16,500万个反应孔,测序通量为2个人外显子组大小,Ion PII™芯片包括66,000万个反应孔,测序通量为1个人基因组大小。
依托Ion Proton测序系统卓越高效的性能,烈冰为研究者提供专业精确的基因组学(全基因组学,Ampliseq全外显子组测序),转录组学(全转录组测序,Small RNA测序,lncRNA测序,Amliseq全转录组测序),宏基因组学(16s rDNA测序,宏转录组学,宏基因组学)。

 
 
优势

1. IonProton测序仪是基于新一代的半导体测序技术,此技术已让IonProton测序仪成为世界上测序速度最快的测序仪,具有极快的测序速度以及灵活的测序能力。
2. IonProton测序仪具有极佳的测序精度,碱基准确性能够达到Q20
3. IonProton测序仪具有天生的链特异性,能够非常准确地鉴定新的lncRNA,并准确定量几乎所有的lncRNA。
4. IonProton具有全球最好的配套支持系统——Ampliseq系统,依托Ampliseq系统,可以针对研究者希望研究的区域和片段进行准确定制的分析。
5. IonProton具有更长的测序读长能够使得,转录组学分析,长链非编码RNA研究更为准确,更具可验证性。



运用广泛

全基因组测序
——对于样本的全基因组进行高覆盖深度的重测序,帮助研究者寻找基因突变,拷贝数变异,基因组结构变异,病毒插入位点等重要信息。常应用于植物品系,人类癌症深度的研究。
外显子捕获测序
——极具针对性地对样本的全外显子组进行极高覆盖深度的高精度测序,帮助研究寻找和蛋白表达相关的突变位点,插入缺失位点。常应用于人类疾病突变方面的研究。
全转录组测序
——对于样本的全转录组(RNA)进行大数据量,高覆盖深度的测定,帮助研究寻找和表型变化相关的基因表达差异,可变剪接,融合基因以及新基因的鉴定,应用范围极广,覆盖几乎所有的研究方向。
lncRNA测序
——对于最为前沿的长链非编码RNA的序列进行测序分析后,帮助研究者对于非编码RNA参与生物学进程的机制进行细致深入的研究,应用范围极广,覆盖几乎所有的研究方向。
Small RNA测序
——对于样本中所有的小片段RNA进行捕获后,采取测序分析,帮助研究对于生命体中的包括miRNA,piRNA,snRNA,tRNA等小片段RNA以及其作用机制进行研究,其可应用范围极广,覆盖几乎所有的研究方向。
Ampliseq全转录组测序
——对于样本中所有的mRNA对应的基因,按照实时荧光定量PCR技术的捕获方式以及Ampliseq捕获系统,针对每一个基因设计捕获引物,对于基因表达进行精确测定,其精度媲美qPCR技术,同时其可应用于石蜡样本以及微量样本(最低500pg),为普通研究者研究极微量样本提供可能,极大地扩展了转录组测序的应用面。
Ampliseq全外显子组测序
——对于样本中所有基因的外显子组序列,采用Ampliseq靶向捕获,针对每一个基因的外显子区域设计捕获,相对于普通的外显子组测序,具有更好的外显子覆盖率,更高的有效测序率,帮助研究者更好地对于数据进行分析。
16s rRNA测序
——对于环境微生物序列,不同于普通方式,Ion Proton采用Ampliseq靶向捕获的方式对于16s rRNA序列进行序列测定,帮助研究者对于环境中的不同微生物的丰度进行精确鉴定,常应用于人类健康,环境监测等领域。

 
 
Ion Torrent Proton
芯片类型 Proton I Proton II
# of sensors 165M 660M
产出数据 ~10Gb ~100Gb
运行时间 2.5 hrs 2.5 hrs
读长 ~200bp ~200bp
Reads数目 60-80M 240-330M

 

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