HiSeq 2500 系统是基于诞生于2006年Solexa测序技术的应用较为广泛的高通量测序系统。区别于HiSeq 2000测序系统,它具有快速或者慢速两种模式,并且具有双端125bp(高产模式),150bp(快速模式)的读长,对于De Novo拼接能够提供非常巨大的改善以及帮助,具有应用领域最广的特点,在新物种鉴定,泛转录组学,泛基因组学,癌症,遗传疾病,植物遗传育种,表观遗传学等研究中都有非常优异的表现,尤其适合基因组学的研究。
依托Hiseq测序技术的高精确性和高产量,烈冰生物运用它为客户提供专业的基因组学(全基因组测序,外显子捕获测序,RAD测序),转录组学(全转录组测序,Small RNA测序,circRNA测序),表观遗传学(ChIP测序,MeDIP测序)等方面的测序以及分析服务,力争为客户提供全面准确的解决方案。

 
 
技术特点

1. 极大的数据产量和通量,高输出模式下可产出600G数据量。
2. 极高的数据质量能达到Q20以上的准确性。
3. 双端测序能够使得De Novo测序更为精确,拼接得到N50更长的序列。



运用广泛

全基因组测序
——对于样本的全基因组进行高覆盖深度的重测序,帮助研究者寻找基因突变,拷贝数变异,基因组结构变异,病毒插入位点等重要信息。常应用于植物品系,人类癌症深度的研究。
外显子捕获测序
——极具针对性地对样本的全外显子组进行极高覆盖深度的高精度测序,帮助研究寻找和蛋白表达相关的突变位点,插入缺失位点。常应用于人类疾病突变方面的研究。
全转录组测序
——对于样本的全转录组(RNA)进行大数据量,高覆盖深度的测定,帮助研究寻找和表型变化相关的基因表达差异,可变剪接,融合基因以及新基因的鉴定,应用范围极广,涵盖几乎所有的研究方向。
De Novo 测序
——对于未知物种,或者已知物种的新品系的基因组或者转录组进行测序拼接,帮助研究者对于这些未知的物种的基因序列以及表达情况进行确定。常应用于泛转录组学以及农业方面的研究。
ChIP测序
——对于转录因子,组蛋白等进行染色质免疫共沉淀捕获DNA分子,进行测序分析后,帮助研究者对于转录因子,组蛋白等对于基因的结合上的影响,进行深入细致的研究。
MeDIP测序
——对于基因组DNA的甲基化情况进行抗体捕获甲基化片段,进行测序分析后,帮助研究者对于基因的甲基化区域等进行深入细致的研究。
circRNA测序
——对于最为前沿的环状RNA的序列进行测序分析后,帮助研究者对于环状RNA对于基因表达的影响进行细致深入的研究。

 
 
HiSeq 2500 性能参数
性能参数 高产出模式 快速模式
读长 (bp) 2 × 125 2 × 125 2 × 150
产出(Gb) ~600 ~120 ~180
运行时间 ~11 days ~27 days ~39 days
Bases > Q30 > 80% > 80% > 75%
过滤后Reads > 90% > 90% > 90%
flow cells数量 2 2 2
Lanes/flow cell 8 2 2
簇生成 cBot onboard onboard
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