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为什么使用Small RNA测序?

Small RNA主要包括miRNA、siRNA、snRNA、snoRNA、piRNA、tsRNA(tRF&tiRNA)等,是一类不具有蛋白编码能力的RNA分子,能调控基因表达,在细胞生长、发育、代谢等基础生物学过程中都扮演着重要的角色,甚至在癌症等相关疾病形成过程中也起着关键的作用。高通量测序技术省去了烦琐的Small RNA克隆文库构建过程,可以一次性生成上百万条Small RNA序列,能够快速鉴定特定条件下表达的已知Small RNA并发现新的Small RNA,同时还可以研究不同条件下Small RNA的表达差异,并可以联合转录组测序表达谱数据进行关联分析。

为什么选择烈冰科技?

  • 经验丰富的技术人员和专业的生物信息团队,结合多年经验,针对动物(包括外泌体)Small RNA(miRNA、piRNA、tsRNA)、植物Small RNA(miRNA、siRNA)等为您提供定制化实验分析方案。
  • Ion Proton测序平台:使用单端测序+链特异性测序,对miRNA有先天优势;
  • 分辨率高,可以检测到miRNA单个碱基的差异,可区分相同家族以及序列极为相似的不同小RNA分子;
  • 不仅能高效准确发现并注释非模式物种新的miRNA,还能进行piRNA、tiRNA、tRF、siRNA等最新的研究;
  • 及时更新miRBase、miRanda、RNAhybrid等专业miRNA数据库以及靶基因预测算法,保证分析结果紧跟国际最前沿;

1、 研究small RNA的生物学功能


2、 Small RNA的靶标分析和调控网络


3、 预测新的small RNA并定量其表达


4、 piRNA、tiRNA、tRF、siRNA等定制分析


5、 结合其他组学数据(mRNA、lncRNA、circRNA、甲基化等),进行深入挖掘

1、small RNA与肿瘤(miRNA在很多肿瘤中调控癌基因的表达,研究癌症发生的原因和抑制癌细胞生长)


2、small RNA与病毒感染(研究宿主与病毒间的microRNA-mRNA相互作用机制)


3、small RNA与免疫反应(人体免疫反应非常依赖各种信号通路,研究小RNA如何调控这些信号强度,从而做出免疫应答)


4、small RNA介导的基因沉默(植物内源small RNA在调控基因表达过程中起重要作用,它们可以通过激活或抑制特定基因的表达,从而影响植物的多个生物学过程。)

1. 组织样品


动物组织:>200mg


植物组织:>200mg


细胞培养:>2x10^6个


全血:>3ml


菌体:>2x10^6个或>300mg

2. RNA样品


1)请提供体积15 μL - 100 μL,总量≥10μg,浓度≥ 200ng/μL的RNA;


2)OD260/280介于1.8~2.2之间,OD260/230≥2.0,RIN≥6.5,28S:18S≥1.0,确保RNA无降解;


3)送样时请标记清楚样品编号,管口使用Parafilm膜密封;


4)样品保存期间切忌反复冻融;


5)送样时请使用干冰运输。


3. 不同样品之间存在差异,详情请向烈冰咨询


实验流程

数据分析流程

>>动物小rna






>>植物小rna


文献示例

1. Liu R, et al. DNMT1-microRNA126 epigenetic circuit contributes to esophageal squamous cell carcinoma growth via ADAM9-EGFR-AKT signaling. Clin Cancer Res. 2015 Feb 15;21(4):854-63. (IF=8.193)
DNMT1-microRNA126表观遗传回路通过ADAM9-EGFR-AKT信号通路促进食管鳞状细胞癌生长

2. He Q, et al. Downregulation of miR-7116-5p in microglia by MPP1 sensitizes TNF-a production to induce dopaminergic neuron damage. Glia. 2017 Aug;65(8):1251-1263. (IF=6.2)
小胶质细胞中miR-7116-5p的敲低诱导TNF-α产生,导致多巴胺能神经元损伤

3. Xu C, et al. Integrated microRNA-mRNA analyses reveal OPLL specific microRNA regulatory network using high-throughput sequencing. Sci Rep. 2016 Feb 12;6:21580. (IF=5.578)
利用高通量测序microRNA-mRNA调控网络分析揭秘OPLL特异性microRNA调控网络

4. Cheng T, et al. MeCP2 Suppresses Nuclear MicroRNA Processing and Dendritic Growth by Regulating the DGCR8/Drosha Complex. Dev Cell. 2014 Mar 10;28(5):547-60. (IF=14.08)
MeCP2通过调控DGCR8 / Drosha复合物抑制核微小RNA加工和树突生长

5. Su X, et al. miRNomes of haematopoietic stem cells and dendritic cells identify miR-30b as a regulator of Notch1. Nat Commun. 2013;4:2903. (IF=10.02)
miRNomes的造血干细胞和树突状细胞识别miR-30b调节Notch1

6. Xu C, et al. miRNA-100 Inhibits Human Bladder Urothelial Carcinogenesis by Directly Targeting mTOR. Molecular Cancer Therapeutics. 2013, Feb 12:207-219. (IF=5.599)
miRNA-100通过直接靶向调节mTOR来抑制人膀胱尿路上皮癌变