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为什么使用转录组测序?

转录组学,是一门在整体水平上研究细胞中所有基因转录及转录调控规律的学科。转录组测序的研究对象是特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA的总和。新一代高通量测序技术能够全面快速的获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,从而准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs或SSR)等生命科学的重要问题。转录组测序分析已广泛应用于临床诊断、基础研究和药物研发等领域。

为什么选择烈冰科技?

  • NovelBio团队拥有多年转录组测序分析经验,自主研发了多个国际认可的软件,如差异可变剪接算法ASD、CASH等,检出率和准确度超过同类软件;
  • 不依赖已有物种信息,可研究非模式物种,针对不同平台的数据,制定多套流程;
  • 整合了众多学界公认的转录组相关数据库,从本质上提高后期分析的广度和精度;


1、定量基因表达,找出关键基因;


2、研究基因的可变剪接;


3、构建自己的转录组数据库;


4、个性化分析(基因结构的优化、新转录本预测、SNP分析、Indel分析等);


结合其他组学的数据(如DNA甲基化、组蛋白修饰等),进行深入分析。



1、在动植物研究领域,可以通过转录组测序来从头构建某一物种的参考基因集,或者通过转录组测序的数据对已有


的基因集进行补充和优化;


2、在医学研究领域,可以通过转录组测序来找出疾病与正常组织差异表达的基因,或者寻找疾病组织特异表达的基


因或转录本(融合基因、新转录本等),用于寻找疾病特异的biomarker。


1、组织样品


动物组织≥1g


植物组织≥2g


细胞样品≥1×10^6个


全血≥2mL


菌体≥10^6个或≥30mg


2、RNA样品;


样品需求量:RNA≥10 μg;


样品浓度:RNA样品≥100 ng/μl;

样品纯度:OD260/OD280在1.8-2.2之间,


OD260/OD230≥2,


28S/18S≥1,


动物样品RIN≥7.0,


植物样品RIN≥6.5,


RNA无明显降解;


3、不同样品之间存在差异,详情请向烈冰咨询

实验流程

数据分析流程


文献示例

1. Wei, J. et al. The GARP Complex Is Involved in Intracellular Cholesterol Transport via Targeting NPC2 to Lysosomes. Cell Rep. 2017 Jun;19(13):2823-2835.(IF=8.282)
GARP复合物通过促进NPC2到溶酶体的转运参与细胞内胆固醇运输

2.Wu, W. et al. CASH: a constructing comprehensive splice site method for detecting alternative splicing events. Brief Bioinform. 2017 Feb;1-13. doi:10.1093/bib/bbx034 (IF=5.134)
CASH:通过构建综合拼接点的方法检测可变剪接事件

3. Liu Z,et al.Autism-like behaviours and germline transmission in transgenic monkeys overexpressing MeCP2. Nature. 2016 Feb 4;530(7588):98-102. (IF=41.456)
过表达MeCP2的转基因猴子的自闭症行为和种系遗传

4.Hu, Y. et al. Interactions of OsMADS1 with floral homeotic genes in rice flower development. Mol. Plant 2015 Sep;8(9):1366-1384 (IF=8.827)
OsMADS1与花卉同源基因在水稻花发育中的相互作用

5.Wang F, et al. Alternative splicing of the androgen receptor in polycystic ovary syndrome. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Apr 14;112(15):4743-8. (IF=9.681)
雄激素受体在多囊卵巢综合征中的可变剪接


6.Zhou X, et al. Transcriptome analysis of alternative splicing events regulated by SRSF10 reveals position-dependent splicing modulation. Nucleic Acids Res. 2014 Apr;42(6):4019-30. (IF=8.278)
由SRSF10调控的可变剪接事件的转录组分析揭示位置相关的拼接调制

7. Xu J, et al. DNMT3A Arg882 mutation drives chronic myelomonocytic leukemia through disturbing gene expression/DNA methylation in hematopoietic cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Feb 18;111(7):2620-5. (IF=9.681)
DNMT3A Arg882突变通过干扰造血细胞中的基因表达/ DNA甲基化来驱动慢性骨髓单核细胞性白血病


8.Zhang H, et al. Mutation in CSA creates a new photoperiod-sensitive genic male sterile line applicable for hybrid rice seed production. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Jan 2;110(1):76-81. (IF=9.674)
CSA的突变创造了一个适用于杂交水稻制种的新型光敏感雄性不育系