服务热线400-065-1811
当前位置:首页 > 基因测序 > CpG岛精准甲基化测序

为什么使用CpG岛精准甲基化测序?

CpG岛是基因组中一些富含双核苷酸 “CG”的区域,具有重要的招募转录因子的作用,其高甲基化状态会影响其对转录因子的招募,从而影响了基因表达。哺乳动物DNA甲基化主要即为CG型,而富含CpG二核苷酸的CpG岛常位于转录调控区附近,与56%的人类基因组编码基因相关。上海烈冰与Agilent公司联手推出的CpG岛精准甲基化测序,采用SureSelect系统进行靶标富集,全面覆盖基因组中最具表观遗传学研究意义的区域,极大提高测序数据有效性,达到单碱基分辨率,同时降低成本,缩短测序时长,实现多样本实验。

为什么选择烈冰科技?

  • 精准覆盖:采用SureSelect靶标富集系统,可覆盖370万CpG,包括CpG岛、GENCODE启动子、癌症以及组织特异性DMR等,对具有生物学意义的甲基化位点实现全面覆盖
  • 高深度:只需10Gb数据可达100乘覆盖深度,是普通测序深度的3倍,极大提高了对低频甲基化位点的探测率
  • 高灵敏度:采用Bisulfite转化前捕获,对甲基化和非甲基化均等捕获;单碱基分辨率,可精准检测每个胞嘧啶的甲基化状态
  • 低成本、高效率:使用液体捕获技术,大大提高捕获效率;同时靶标区域的选择策略可降低成本,得以实现多样本快速实验

1、CpG岛以及岛岸/岛架的甲基化状态


2、组织特异性DMR在不同组织样本中的甲基化差异


3、癌症等疾病相关区域的甲基化异常对疾病的影响


4、启动子、增强子和Dnase Ⅰ高敏感位点等调控序列的甲基化对基因表达的影响


1、表观遗传学研究:DNA甲基化在维持正常的细胞功能、染色体结构、X染色体失活等方面起重要作用,有利于对人体表观遗传学的研究


2、早期癌症检测:单基因及基因组水平DNA甲基化异常改变被视为细胞恶性转化的标记,通过对基因进行甲基化测序可检测早期癌症


3、胚胎发育研究:DNA甲基化在遗传标记,胚胎发育过程中担任重要作用,可用于胚胎发育研究


4、iPS和干细胞研究:可用于干细胞分化过程和iPS细胞的甲基化分析和检测

(1)组织样品≥50mg


(2)DNA样品


请提供总量≥3μg/样本,浓度≥100ng/μL的DNA;OD260/280介于1.8-2.0之间;

电泳检测无明显RNA污染,基因组条带清晰、完整,无降解;送样时请标记清楚样品编号,管口使用Parafilm膜密封;

样品保存期间切忌反复冻融;送样时请使用干冰运输。


注:不同样品之间存在差异,详情请向烈冰咨询

实验流程

数据分析流程

结果示例

文献示例